27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0513 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  48.83 
 
 
271 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  46.69 
 
 
269 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  46.3 
 
 
269 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  38.65 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  28.57 
 
 
273 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  28.83 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  27.07 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  29.66 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.66 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  30.77 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  32.06 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  32.96 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  27.55 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  28.32 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  28.57 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  26.62 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  26.81 
 
 
378 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  27.2 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  23.26 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  22.9 
 
 
288 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0261  hypothetical protein  25.78 
 
 
250 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.09 
 
 
325 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4233  CRISPR-associated Cas5e family protein  46.34 
 
 
78 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.500518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  26.83 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  23.33 
 
 
243 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>