70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2767 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  597  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  56.29 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  25.52 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  26.82 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  25.65 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  27.56 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.49 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.56 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  31.08 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.62 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.28 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  28.39 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  31.65 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  29.68 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  26.99 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  26.99 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.63 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  28.63 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.39 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  26.34 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  26.94 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  25.31 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  26.5 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  26.92 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  27.46 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.09 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  27.46 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.4 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  26.8 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  27.05 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  26.62 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.9 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 530 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  27.91 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  30.73 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  26.6 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  25.5 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  25.18 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.76 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.63 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  32.39 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  23.84 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  26.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  24.21 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  26.69 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  25.96 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.18 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  30.18 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.89 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>