37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1873 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  99.66 
 
 		 290 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  84.64 
 
 		 293 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  35.99 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  32.73 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  34.1 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  31.01 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  35.64 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  33.68 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  27.14 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  27.34 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  28.82 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.2 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  25.37 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  21.82 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  25.65 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.75 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.75 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  22.79 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  24.41 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  21.17 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  26.3 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.43 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.15 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.45 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>