13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3496 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  100 
 
 		 302 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  50.57 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  48.52 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  40.88 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  30.34 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  31.46 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  31.46 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  28.41 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  30.57 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  27.65 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  31.34 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  28.27 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  24.41 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>