75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3384 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  56.29 
 
 
321 aa  278  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  27.27 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  27.62 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  27.15 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  27.84 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  27.84 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.78 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  28.03 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.05 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.57 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  27.39 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.67 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.52 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  28.75 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.77 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  26.29 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.03 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  29.76 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.45 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.44 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  27.74 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.08 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.67 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.37 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.37 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  27.51 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.27 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.56 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  26.55 
 
 
310 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.11 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  29.09 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  27.48 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  28.52 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  28.52 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  26 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.03 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.51 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.24 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.51 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.32 
 
 
305 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.03 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.03 
 
 
305 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  21.33 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  29.44 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  26.35 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  23.51 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  26.35 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  28.52 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.39 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  26.34 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  25.25 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  26.86 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  26.05 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.67 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.16 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.32 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.75 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  27.27 
 
 
311 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
319 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>