38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1032 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  84.64 
 
 
293 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  85.12 
 
 
290 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  34.72 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  36.93 
 
 
303 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  31.03 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  29.37 
 
 
302 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  31.25 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  27.15 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  26.64 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  25.86 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.27 
 
 
294 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  24.81 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  26.05 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  28.57 
 
 
379 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.6 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  24.06 
 
 
298 aa  45.8  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.38 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  21.05 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.13 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  34.78 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  34.78 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  33.91 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  29.06 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>