22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2360 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  574  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  66.55 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  48.9 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  41.72 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  36.93 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  35.71 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  32.33 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  31.75 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  27.69 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  27.69 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  29.76 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.62 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  25.85 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  27.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.03 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.82 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  33.03 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  33.03 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.64 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>