25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1065 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1065  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  584  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2773  hypothetical protein  63.12 
 
 
316 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1032  hypothetical protein  34.84 
 
 
293 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0528769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1873  hypothetical protein  35.82 
 
 
293 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.593303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1804  hypothetical protein  35.82 
 
 
290 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2360  hypothetical protein  32.54 
 
 
303 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1838  hypothetical protein  32.46 
 
 
316 aa  99  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00402348  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1498  hypothetical protein  37.31 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.378704  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3496  membrane protein  30.45 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1814  hypothetical protein  29.18 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1815  hypothetical protein  29.18 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.29 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.2 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 
306 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  26.13 
 
 
379 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  25.97 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.42 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  32.38 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2767  hypothetical protein  27.17 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.15508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.78 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.1 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  25.96 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3384  hypothetical protein  28.06 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>