More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0852 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  75.35 
 
 		 578 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  72.07 
 
 		 608 aa  807    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  69.56 
 
 		 600 aa  768    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  74.7 
 
 		 595 aa  804    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  100 
 
 		 602 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  70.27 
 
 		 597 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  74.7 
 
 		 595 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.42 
 
 		 627 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.77 
 
 		 641 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.39 
 
 		 632 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.86 
 
 		 639 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.68 
 
 		 616 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  50.76 
 
 		 634 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.5 
 
 		 597 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  51.78 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 		 619 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.45 
 
 		 628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  51.36 
 
 		 600 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.89 
 
 		 629 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  51.82 
 
 		 650 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  52.23 
 
 		 599 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.41 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  52.05 
 
 		 681 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.41 
 
 		 605 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  51.71 
 
 		 608 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  51.87 
 
 		 601 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.05 
 
 		 601 aa  542  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  50.77 
 
 		 622 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.81 
 
 		 619 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 586 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.74 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.86 
 
 		 616 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  50.6 
 
 		 618 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.6 
 
 		 618 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  47.98 
 
 		 589 aa  528  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.94 
 
 		 606 aa  529  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  51.29 
 
 		 580 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.35 
 
 		 586 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.57 
 
 		 600 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50 
 
 		 614 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  47.07 
 
 		 586 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  48.79 
 
 		 606 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.68 
 
 		 605 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  50.52 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.83 
 
 		 590 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  49.14 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.58 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  46.38 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  50.26 
 
 		 594 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.54 
 
 		 605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  47.18 
 
 		 589 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.83 
 
 		 631 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  49.4 
 
 		 611 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  48.56 
 
 		 601 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.32 
 
 		 637 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.35 
 
 		 603 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3622  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.55 
 
 		 587 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  49.91 
 
 		 588 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.68 
 
 		 617 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.49 
 
 		 620 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.74 
 
 		 597 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.78 
 
 		 587 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  49.05 
 
 		 598 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2049  ABC transporter, transmembrane region  47.94 
 
 		 616 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1636  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.59 
 
 		 568 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.62 
 
 		 589 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.34 
 
 		 606 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.08 
 
 		 590 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.32 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.71 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.27 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.16 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1659  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.81 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.34 
 
 		 618 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  46.56 
 
 		 643 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 598 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  48.34 
 
 		 595 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  48.43 
 
 		 597 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.26 
 
 		 613 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.89 
 
 		 634 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  48.3 
 
 		 592 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.97 
 
 		 644 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.63 
 
 		 634 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.63 
 
 		 644 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  48.42 
 
 		 593 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  43.4 
 
 		 625 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4256  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  50.26 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0888  ABC transporter related  46.66 
 
 		 600 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0973  ABC transporter related  46.83 
 
 		 600 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1279  ABC transporter-related protein  50.51 
 
 		 612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173874  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  41.38 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  42.3 
 
 		 600 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  38.02 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  39.72 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  38.99 
 
 		 596 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.41 
 
 		 601 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  40.28 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>