245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2269 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2269  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
445 aa  878    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.38 
 
 
452 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 
454 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 
470 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.16 
 
 
468 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 
453 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.32 
 
 
449 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  36.41 
 
 
475 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.24 
 
 
443 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.17 
 
 
453 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.71 
 
 
458 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.56 
 
 
450 aa  202  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.79 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.21 
 
 
486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  30.07 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.84 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  29.78 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  30.07 
 
 
447 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  30.07 
 
 
447 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.1 
 
 
454 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.72 
 
 
452 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  30.98 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.75 
 
 
446 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.52 
 
 
446 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.5 
 
 
446 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 
446 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.52 
 
 
446 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  35.92 
 
 
455 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  34.88 
 
 
459 aa  193  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  33.42 
 
 
486 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  34.77 
 
 
461 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  30.96 
 
 
458 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1598  sodium:neurotransmitter symporter  33.57 
 
 
486 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.45 
 
 
452 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  29.37 
 
 
461 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.22 
 
 
464 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.52 
 
 
446 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  30.84 
 
 
446 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  30.16 
 
 
461 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.3 
 
 
446 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.3 
 
 
446 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.92 
 
 
452 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.49 
 
 
452 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.58 
 
 
476 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.07 
 
 
446 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.4 
 
 
464 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  27.88 
 
 
454 aa  188  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.42 
 
 
453 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.34 
 
 
457 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.12 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  30.36 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.55 
 
 
456 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  31.48 
 
 
447 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  30.94 
 
 
455 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  29.33 
 
 
488 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.26 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.42 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.04 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  29.8 
 
 
451 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  33.87 
 
 
463 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.12 
 
 
454 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  33.59 
 
 
502 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  29.93 
 
 
494 aa  179  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.7 
 
 
448 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  28.9 
 
 
486 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.17 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  31.96 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  30.27 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  26.98 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  28.18 
 
 
527 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  30.02 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  33.01 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  33.01 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.18 
 
 
483 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  33.01 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.26 
 
 
465 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  32.77 
 
 
445 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  31.25 
 
 
461 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 
484 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  32.77 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  32.15 
 
 
446 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  28.1 
 
 
473 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  32.77 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.01 
 
 
445 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  31.23 
 
 
508 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.8 
 
 
450 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
445 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
445 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  27.82 
 
 
488 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  31.23 
 
 
508 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.58 
 
 
449 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  31.23 
 
 
508 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  28.77 
 
 
447 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>