73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1633 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  358  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  29.69 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  34.83 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  29.6 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  34.65 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  35.43 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  35.43 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  29.46 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  35.71 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  31.2 
 
 
880 aa  62  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  34.85 
 
 
164 aa  61.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  31.58 
 
 
441 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  29.27 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  36.89 
 
 
470 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  29.17 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  34.82 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  27.91 
 
 
882 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  29.46 
 
 
888 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  27.11 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  36.84 
 
 
434 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  27.34 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  34.21 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  31.75 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  26.98 
 
 
885 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  34.71 
 
 
436 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  32.58 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  36.51 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  35.48 
 
 
437 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  28.12 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  32.82 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  28.12 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  32.79 
 
 
517 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  35.48 
 
 
440 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  31.78 
 
 
507 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  28.91 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  28.68 
 
 
518 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  25.78 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  28.68 
 
 
519 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  30.68 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  28.35 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  28.57 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  35.11 
 
 
471 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  28.68 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  29.71 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  29.6 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  28.33 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  26.98 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  34.26 
 
 
484 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1473  protein of unknown function DUF901  34.02 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  26.98 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  31.3 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  24.54 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  27.34 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  29.03 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  34.13 
 
 
449 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  29.17 
 
 
265 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  24.12 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  24.12 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  27.43 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  24.34 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  30.53 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36358  predicted protein  25.85 
 
 
354 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  27.03 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>