25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2273 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  363  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  42.94 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  38.98 
 
 
176 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  40.83 
 
 
164 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  37.87 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  36.97 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  34.19 
 
 
434 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  34.57 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  34.4 
 
 
471 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  33.33 
 
 
519 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  57.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  31.93 
 
 
470 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  36.51 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  31.93 
 
 
507 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  32.43 
 
 
441 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  29.41 
 
 
425 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  31.93 
 
 
437 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  31.53 
 
 
449 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  28.49 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 
484 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  31.03 
 
 
440 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  26.32 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  29.17 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  31.45 
 
 
265 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  26.21 
 
 
885 aa  40.8  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>