44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1179 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  37.89 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  37.7 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  36.41 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  31.06 
 
 		 507 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  30 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  29.1 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  28.57 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  32.28 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  28.8 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  28.8 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  28.82 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  32.82 
 
 		 519 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  32.82 
 
 		 518 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  34.65 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  33.87 
 
 		 437 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  34.15 
 
 		 440 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  29.51 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  30.81 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  29.37 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  30.94 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  31.01 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  26.42 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  26.06 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  26.06 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  44.7  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  28.19 
 
 		 168 aa  44.7  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  24.86 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  26.63 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  24.26 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  28.34 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  28.34 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  32.52 
 
 		 471 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  32.31 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  26.49 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  24.48 
 
 		 882 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>