More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1053 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  100 
 
 		 880 aa  1819    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  71.12 
 
 		 882 aa  1327    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  51.41 
 
 		 642 aa  682    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  76.08 
 
 		 888 aa  1420    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  76.7 
 
 		 885 aa  1415    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  51.32 
 
 		 640 aa  670    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  46.2 
 
 		 646 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  46.05 
 
 		 646 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  50.58 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  30.05 
 
 		 647 aa  277  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  30.11 
 
 		 647 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 647 aa  272  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  29.9 
 
 		 639 aa  271  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  29.41 
 
 		 647 aa  270  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  31.39 
 
 		 656 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  30.03 
 
 		 647 aa  268  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  29.98 
 
 		 647 aa  268  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.79 
 
 		 647 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  29.57 
 
 		 647 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  29.57 
 
 		 647 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.91 
 
 		 647 aa  261  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  31.15 
 
 		 632 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  30.11 
 
 		 639 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  28.74 
 
 		 691 aa  259  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  30.39 
 
 		 662 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.61 
 
 		 692 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  30.71 
 
 		 651 aa  254  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  28.21 
 
 		 694 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  28.06 
 
 		 694 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  27.61 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  28.19 
 
 		 691 aa  252  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.65 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.17 
 
 		 692 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.77 
 
 		 691 aa  251  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  27.02 
 
 		 695 aa  251  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  27.13 
 
 		 692 aa  250  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.88 
 
 		 691 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.94 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.45 
 
 		 694 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  28.1 
 
 		 688 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  248  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  247  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.37 
 
 		 692 aa  247  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  27.19 
 
 		 693 aa  247  8e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  26.87 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.56 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.75 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  26.61 
 
 		 693 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  27.29 
 
 		 697 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  26.63 
 
 		 694 aa  245  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  27.04 
 
 		 673 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.77 
 
 		 690 aa  244  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  27.02 
 
 		 691 aa  244  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  27.49 
 
 		 697 aa  244  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.88 
 
 		 691 aa  244  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  27.38 
 
 		 699 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 652 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  28.19 
 
 		 692 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  28.38 
 
 		 688 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  27.63 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  27.23 
 
 		 699 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  28.83 
 
 		 688 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  26.36 
 
 		 695 aa  241  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  27.71 
 
 		 698 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.87 
 
 		 689 aa  241  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.88 
 
 		 715 aa  241  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.26 
 
 		 692 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  240  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  27.16 
 
 		 697 aa  240  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  27.7 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  27.63 
 
 		 700 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  26.95 
 
 		 699 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000439347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  26.5 
 
 		 698 aa  239  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  27.2 
 
 		 699 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.11 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  27.56 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  28.21 
 
 		 691 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  27.56 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  26.9 
 
 		 693 aa  239  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  27.56 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  28.13 
 
 		 693 aa  238  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.74 
 
 		 706 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  27.62 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  26.21 
 
 		 697 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  238  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.34 
 
 		 691 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  27.41 
 
 		 692 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  27.95 
 
 		 700 aa  237  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.23 
 
 		 698 aa  237  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  27.97 
 
 		 692 aa  237  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  28.09 
 
 		 700 aa  237  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  26.85 
 
 		 692 aa  237  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.25 
 
 		 692 aa  237  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  27.89 
 
 		 692 aa  237  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  26.95 
 
 		 702 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  27.77 
 
 		 700 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>