54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2419 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  38.65 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  36.09 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  38.24 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  39.26 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  40 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  38.18 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  35.37 
 
 		 888 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  37.57 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  35.54 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  35.29 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  33.93 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  33.13 
 
 		 885 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  34.34 
 
 		 882 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  35.84 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  31.43 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  36.72 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  36.72 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  37.85 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  35.58 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  32.52 
 
 		 880 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  30.64 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  30.64 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  30.23 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  31.84 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  31.21 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  36.24 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  30.86 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  32.43 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  32.76 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0123  RNA-binding protein  39.29 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  27.81 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  30 
 
 		 441 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  29.75 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  27.94 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  30.83 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  28.34 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  30.3 
 
 		 425 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36358  predicted protein  26.83 
 
 		 354 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  23.95 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>