31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2512 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  45.66 
 
 		 174 aa  153  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  47.88 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  42.77 
 
 		 170 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  40.83 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  39.38 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  30.58 
 
 		 434 aa  58.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  33.06 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  28 
 
 		 471 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  25.6 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  28.31 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  26.32 
 
 		 888 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  26.92 
 
 		 437 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  29.6 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  26.32 
 
 		 425 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  28.35 
 
 		 518 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  28.35 
 
 		 519 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  25.78 
 
 		 885 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  24.53 
 
 		 880 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  28.03 
 
 		 441 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  27.87 
 
 		 440 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  26.92 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  28.93 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  26.58 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  23.95 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  23.95 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  27.98 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>