19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2120 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  352  8.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  45.51 
 
 
176 aa  147  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  42.77 
 
 
164 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  40.94 
 
 
174 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  39.13 
 
 
167 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  36.97 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  26.12 
 
 
888 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  28.8 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  29.71 
 
 
885 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  28.7 
 
 
880 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  26.45 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  29.55 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  27.56 
 
 
882 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  28.93 
 
 
265 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  26.58 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  27.72 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  29.85 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  28.57 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  30.77 
 
 
519 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>