More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0033 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  68.64 
 
 		 882 aa  1307    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  100 
 
 		 888 aa  1837    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  73.55 
 
 		 885 aa  1385    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  76.08 
 
 		 880 aa  1420    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  51.48 
 
 		 642 aa  676    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  52.27 
 
 		 640 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  47.29 
 
 		 646 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  46.51 
 
 		 646 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  52.07 
 
 		 751 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  31.17 
 
 		 639 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.4 
 
 		 647 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  29.52 
 
 		 647 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  30.34 
 
 		 651 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  29.03 
 
 		 647 aa  269  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  29.58 
 
 		 647 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  28.99 
 
 		 647 aa  268  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  30.72 
 
 		 639 aa  265  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  28.73 
 
 		 647 aa  265  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  28.71 
 
 		 647 aa  265  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  28.71 
 
 		 647 aa  265  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  29.1 
 
 		 691 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  27.6 
 
 		 647 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.89 
 
 		 647 aa  261  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  30.72 
 
 		 632 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  30.26 
 
 		 656 aa  256  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  26.76 
 
 		 695 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  28.17 
 
 		 689 aa  255  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  29.83 
 
 		 652 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  30.19 
 
 		 662 aa  254  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  26.75 
 
 		 693 aa  251  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.14 
 
 		 692 aa  250  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  26.75 
 
 		 693 aa  249  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  27.92 
 
 		 688 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.13 
 
 		 691 aa  248  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.91 
 
 		 692 aa  247  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.13 
 
 		 691 aa  247  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.61 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  26.98 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.56 
 
 		 698 aa  245  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  26.88 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  27.95 
 
 		 694 aa  244  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.46 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  26.69 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  28.09 
 
 		 694 aa  244  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  26.09 
 
 		 695 aa  244  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  26.98 
 
 		 691 aa  244  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.53 
 
 		 691 aa  243  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.21 
 
 		 695 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  26.89 
 
 		 673 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  26.16 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  26.46 
 
 		 693 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  26.94 
 
 		 690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.39 
 
 		 692 aa  242  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  241  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  26.39 
 
 		 691 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  27.18 
 
 		 697 aa  241  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  26.96 
 
 		 691 aa  241  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  27.05 
 
 		 691 aa  241  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  27.23 
 
 		 700 aa  241  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  28.8 
 
 		 691 aa  240  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.74 
 
 		 692 aa  240  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.18 
 
 		 692 aa  240  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  25.7 
 
 		 693 aa  240  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  240  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  240  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  27.12 
 
 		 697 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  27.47 
 
 		 697 aa  239  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.77 
 
 		 700 aa  239  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  26.63 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  27.91 
 
 		 699 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  26.2 
 
 		 694 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  26.81 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  26.06 
 
 		 697 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  27.3 
 
 		 691 aa  238  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  26.71 
 
 		 700 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  27.01 
 
 		 703 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  27.67 
 
 		 700 aa  237  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  26.76 
 
 		 692 aa  237  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  26.4 
 
 		 697 aa  237  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  26.72 
 
 		 691 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  26.97 
 
 		 691 aa  237  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  26.85 
 
 		 700 aa  237  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  27.08 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  27.33 
 
 		 684 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  26.43 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  27.76 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.34 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  27.78 
 
 		 697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  26.75 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  26.75 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  26.99 
 
 		 700 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>