19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2731 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  47.67 
 
 
176 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  45.66 
 
 
164 aa  153  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  40.94 
 
 
170 aa  124  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  37.87 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  41.04 
 
 
167 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  31.75 
 
 
434 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  28.24 
 
 
265 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  30.77 
 
 
437 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  24.43 
 
 
888 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  25.81 
 
 
471 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  30.17 
 
 
168 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  25.78 
 
 
518 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  29.03 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  25.78 
 
 
519 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  27.08 
 
 
169 aa  44.3  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  28.21 
 
 
440 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  24.44 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  22.69 
 
 
882 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>