22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2532 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  346  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  42.94 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  39.13 
 
 
170 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  39.29 
 
 
176 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  41.04 
 
 
174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  39.38 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 
434 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  27.35 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  26.98 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  26.83 
 
 
437 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  29.92 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  25.45 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  20.96 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  24.52 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  26.89 
 
 
470 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  29.75 
 
 
507 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  26.59 
 
 
246 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  25.6 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  28.1 
 
 
518 aa  40.8  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  23.35 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>