25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3242 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  100 
 
 		 434 aa  821    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  44.39 
 
 		 517 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  42.06 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  39.36 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  39.03 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  34.89 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  37.31 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  39.2 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  38.58 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  36.91 
 
 		 507 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  38.08 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  38.99 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  35.51 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  36.73 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  44.68 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  34.19 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  34.71 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  30.58 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  31.01 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  31.75 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  32.74 
 
 		 179 aa  47.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  27.18 
 
 		 168 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  39.13 
 
 		 169 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>