22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2270 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  100 
 
 		 246 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  32.31 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  33.59 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  32.84 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  31.25 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  29.37 
 
 		 441 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  27.78 
 
 		 517 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  23.85 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  30.3 
 
 		 471 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  27.94 
 
 		 518 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  30 
 
 		 449 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  27.94 
 
 		 519 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  26.35 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  30 
 
 		 484 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  33.86 
 
 		 169 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  30.77 
 
 		 158 aa  42.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  31.17 
 
 		 437 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  29.57 
 
 		 164 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  27.78 
 
 		 470 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>