23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1817 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  66.59 
 
 
436 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  48.74 
 
 
437 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  47.14 
 
 
440 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  44.85 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  46.24 
 
 
441 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  43.71 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  43.55 
 
 
471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  42.76 
 
 
518 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  42.63 
 
 
519 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  37.99 
 
 
507 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  41.07 
 
 
517 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  38.99 
 
 
425 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  37.97 
 
 
470 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  36.6 
 
 
434 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  28.57 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  29.81 
 
 
168 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  36.57 
 
 
169 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  35.54 
 
 
175 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  39.81 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  30.23 
 
 
170 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>