26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1028 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  870    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  60.79 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  54.15 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  52.89 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  52.55 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  46.08 
 
 		 441 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  40.6 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  43.12 
 
 		 518 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  40.78 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  43.71 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  40.76 
 
 		 519 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  37.33 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  38.44 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  38.41 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  46.07 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  35.92 
 
 		 168 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  31.07 
 
 		 168 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  31.53 
 
 		 175 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  30 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  28.12 
 
 		 175 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  27.45 
 
 		 885 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  34.13 
 
 		 175 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  26.47 
 
 		 888 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  31.73 
 
 		 170 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>