27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3126 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  39.68 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  41.4 
 
 
441 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  39.72 
 
 
440 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  39.25 
 
 
437 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  39.53 
 
 
449 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  39.86 
 
 
484 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  38.82 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  39.42 
 
 
519 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  36.28 
 
 
507 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  37.53 
 
 
436 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  39.18 
 
 
437 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  38.43 
 
 
517 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  37.36 
 
 
470 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  37.24 
 
 
434 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  32.84 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  33.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  30.84 
 
 
170 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  26.32 
 
 
164 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  27.34 
 
 
179 aa  44.3  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  29.03 
 
 
175 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  32.26 
 
 
158 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  27.87 
 
 
177 aa  43.1  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>