61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0197 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  351  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  53.25 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  48.24 
 
 
168 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  43.64 
 
 
166 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  41.42 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  41.21 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  40.74 
 
 
168 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  38.65 
 
 
169 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  38.65 
 
 
169 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  40.52 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  36.14 
 
 
880 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  36.05 
 
 
882 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  36.53 
 
 
170 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  34.88 
 
 
888 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  39.64 
 
 
170 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  32.56 
 
 
885 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  35.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  34.52 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  34.71 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  35.06 
 
 
169 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  38.71 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  38.71 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  30.43 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  35.94 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  30.29 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  33.57 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  35.43 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  32.17 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  27.93 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  27.06 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0123  RNA-binding protein  33.33 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  29.85 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  30.95 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  29.66 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  29.66 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  29.17 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  27.78 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  29.1 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  28.57 
 
 
246 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  34.45 
 
 
519 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  34.45 
 
 
518 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  34.95 
 
 
441 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28.31 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  30.84 
 
 
425 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  30.95 
 
 
507 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  29.37 
 
 
192 aa  48.5  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  31.07 
 
 
484 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  30.7 
 
 
436 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 
517 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  24.52 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  32.69 
 
 
437 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  30.63 
 
 
449 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>