32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1302 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  840    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  71.98 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  56.19 
 
 		 484 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  52.87 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  52.89 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  51.02 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  49.1 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  49.2 
 
 		 519 aa  289  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  42.43 
 
 		 507 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  48.74 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  45.98 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  42.95 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  37.58 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  38.79 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  38.16 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  29.69 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  29.69 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  33.59 
 
 		 246 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  36.13 
 
 		 168 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  28.35 
 
 		 175 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  33.87 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  31.93 
 
 		 175 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  30.7 
 
 		 164 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  26.92 
 
 		 168 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  35.43 
 
 		 181 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28.1 
 
 		 164 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  29.84 
 
 		 176 aa  46.6  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  32.23 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  30.68 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  34.31 
 
 		 166 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>