35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3100 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  834    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  66.59 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  47.83 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  46.67 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  45.39 
 
 		 484 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  43.42 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  43.88 
 
 		 441 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  40.37 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  43.32 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  43.32 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  36.59 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  40.62 
 
 		 517 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  38.6 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  36.93 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  35.28 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  34.71 
 
 		 175 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  34.09 
 
 		 169 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  34.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  32.76 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  31.93 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  27.78 
 
 		 246 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  23.85 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  32 
 
 		 181 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  30.7 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  33.82 
 
 		 124 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>