49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3517 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  972    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  89.21 
 
 
519 aa  783    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  52.66 
 
 
507 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  47.96 
 
 
437 aa  316  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  51.39 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  45.56 
 
 
440 aa  301  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  45.28 
 
 
484 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1028  hypothetical protein  43.12 
 
 
449 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.261028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  43.32 
 
 
436 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  44.27 
 
 
471 aa  253  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1817  hypothetical protein  43.09 
 
 
437 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.122477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  44.47 
 
 
517 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  40.39 
 
 
470 aa  200  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  40.5 
 
 
425 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3242  protein of unknown function DUF901  50.29 
 
 
434 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00265784  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  28.36 
 
 
174 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  28.36 
 
 
174 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  42.31 
 
 
168 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  26.67 
 
 
175 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  57.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  29.92 
 
 
164 aa  53.9  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 
168 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  36.19 
 
 
166 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  34.45 
 
 
170 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  32.82 
 
 
192 aa  51.2  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  35.38 
 
 
169 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  27.69 
 
 
170 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  36.19 
 
 
158 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  30.7 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  31.54 
 
 
179 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  32.81 
 
 
170 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  29.55 
 
 
180 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  29.93 
 
 
181 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  35.87 
 
 
169 aa  47.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  28.46 
 
 
177 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2270  protein of unknown function DUF901  27.94 
 
 
246 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00783203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28.35 
 
 
164 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  25.78 
 
 
174 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  30.47 
 
 
170 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  34.12 
 
 
170 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>