18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0052 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  72.39 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  52.8 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  40.38 
 
 		 265 aa  95.5  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  27.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  27.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  28.49 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 882 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  25.17 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  20.96 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  27.94 
 
 		 888 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  33.63 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  30.09 
 
 		 880 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>