17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3314 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  72.39 
 
 		 164 aa  240  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1228  protein of unknown function DUF901  53.99 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  42.24 
 
 		 265 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2903  hypothetical protein  27.59 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.544112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2273  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2512  hypothetical protein  28.3 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.77943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  35.65 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  35.65 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  32 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2532  hypothetical protein  25.44 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.910808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2731  hypothetical protein  25.88 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  31.82 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  31.82 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2120  hypothetical protein  29.63 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  27.78 
 
 		 888 aa  40.8  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  29.81 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>