27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2016 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  97.58 
 
 
124 aa  236  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  69.35 
 
 
124 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  63.49 
 
 
135 aa  147  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3941  hypothetical protein  57 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00759865  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  39.2 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  41.74 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  40.98 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  32.75 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  34.9 
 
 
183 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
292 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  38.98 
 
 
134 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  38.39 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  38.4 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  39.47 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  64.52 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  36.97 
 
 
305 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  32.69 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  34.62 
 
 
441 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  34.82 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  35.88 
 
 
287 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  29.1 
 
 
177 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  36.13 
 
 
471 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10730  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  34.13 
 
 
470 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4686  hypothetical protein  32.11 
 
 
265 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>