56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0089 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  100 
 
 
170 aa  348  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  77.06 
 
 
170 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  56.8 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  55.62 
 
 
170 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  55.03 
 
 
170 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  55.03 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  41.57 
 
 
174 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  41.57 
 
 
174 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  44.87 
 
 
172 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  40.48 
 
 
175 aa  122  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  42.77 
 
 
166 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0123  RNA-binding protein  44.2 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  41.42 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  37.57 
 
 
169 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  37.57 
 
 
169 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  39.64 
 
 
170 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  39.58 
 
 
880 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  40.97 
 
 
888 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  34.94 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  41.61 
 
 
182 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  38.69 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  41.86 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  47.15 
 
 
170 aa  95.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  37.67 
 
 
882 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  37.28 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  43.71 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  37.72 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  33.33 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  35.84 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  37.33 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  37.69 
 
 
885 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  29.89 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  29.89 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  37.34 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  36.18 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  33.1 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  36.09 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  30.86 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  33.08 
 
 
175 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1179  protein of unknown function DUF901  30 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000010276  hitchhiker  0.000023752 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30756  predicted protein  30.72 
 
 
374 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6096  protein of unknown function DUF901  32.8 
 
 
441 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0632781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  30.5 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  32.81 
 
 
519 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  32.81 
 
 
518 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4878  hypothetical protein  32.8 
 
 
507 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36358  predicted protein  26.67 
 
 
354 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  32.69 
 
 
484 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3100  hypothetical protein  31.9 
 
 
436 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288555  normal  0.686964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>