More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1625 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1625  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
357 aa  701    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0650  histidine kinase  39.56 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
336 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  33.78 
 
 
476 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  29.74 
 
 
459 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
524 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
457 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  30.74 
 
 
464 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  29.77 
 
 
483 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  29.23 
 
 
436 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  29.23 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  29.23 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
467 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
481 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  30.58 
 
 
715 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  30.37 
 
 
464 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  23.63 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
640 aa  89.7  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
468 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
490 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
856 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
474 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
474 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
480 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  28.52 
 
 
379 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
493 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
406 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  29.77 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
471 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  31.8 
 
 
572 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
475 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
488 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  33.22 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1023 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  31.76 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.75 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  31.91 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 
463 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
446 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
785 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
504 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
461 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  25.87 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.15 
 
 
1407 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  24.07 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  30.77 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
806 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.49 
 
 
918 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
646 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  30.21 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.1 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  29.49 
 
 
615 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1266 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.52 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
1054 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  32.23 
 
 
596 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  30.87 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  28.69 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>