46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4383 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4383  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 171 aa  344  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.880113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  29.33 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  27.21 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  28.12 
 
 		 596 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  32.31 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  25.27 
 
 		 330 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  26.71 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.72 
 
 		 308 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  26.85 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  33.98 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.34 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  26.87 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.61 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  23.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37290  predicted protein  28.99 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  26.45 
 
 		 225 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  25.98 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.89 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  28.71 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  27.21 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  27.42 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  30.3 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  26.21 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  26.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  26.99 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0450  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  29.58 
 
 		 487 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  29.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  29.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  27.81 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  27.21 
 
 		 611 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  31.68 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  27.01 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  25.31 
 
 		 337 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  28.21 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  23.73 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  27 
 
 		 194 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  22.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  27.73 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.81 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  29.85 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>