159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3137 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3137  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 398 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1400  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.15 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.23 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.41 
 
 		 549 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.29 
 
 		 565 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.66 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.15 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.277077  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  34.31 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  37.33 
 
 		 607 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.75 
 
 		 549 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  35.75 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  36.68 
 
 		 611 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  36.68 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.88 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  34.68 
 
 		 524 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.12 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 566 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  35.75 
 
 		 530 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.02 
 
 		 546 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 461 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  36.56 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.59 
 
 		 525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  36.44 
 
 		 615 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  36.44 
 
 		 615 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.58 
 
 		 536 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.67 
 
 		 547 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  36.44 
 
 		 606 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 535 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  32.64 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  31.25 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  36.44 
 
 		 616 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  36.44 
 
 		 615 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.51 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.51 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 563 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 560 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.9 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.55 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.11 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.11 
 
 		 599 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 		 447 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  33.2 
 
 		 571 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 558 aa  126  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  30.83 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  36.28 
 
 		 575 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 542 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  30.83 
 
 		 446 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.89 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.69 
 
 		 586 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.69 
 
 		 602 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.69 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  30.67 
 
 		 568 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  32.51 
 
 		 558 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.27 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 521 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.75 
 
 		 637 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  36.02 
 
 		 618 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  36.02 
 
 		 618 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.98 
 
 		 572 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  35.24 
 
 		 596 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.78 
 
 		 629 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  35.81 
 
 		 576 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.98 
 
 		 656 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 560 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  32.17 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.06 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.59 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  34.45 
 
 		 564 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 668 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  32.88 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>