32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1523 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1523  putative integrase  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  48.84 
 
 		 335 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  44.57 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  43.68 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  41.3 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  41.3 
 
 		 350 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  40.22 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  46.84 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  41.38 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  39.13 
 
 		 341 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  38.46 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  33.33 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  35.63 
 
 		 352 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  39.08 
 
 		 345 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  37.5 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  36.17 
 
 		 371 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  35.23 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  41.18 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  30 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  34.48 
 
 		 337 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  41.18 
 
 		 326 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  36.26 
 
 		 335 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  38.95 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  35 
 
 		 338 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  34.18 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  30.34 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  31.03 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  30.23 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  30.68 
 
 		 318 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  25.29 
 
 		 336 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>