75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0823 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  67.82 
 
 
87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  63.53 
 
 
85 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  50.59 
 
 
84 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  46.43 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  43.37 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.24 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  42.17 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  49.12 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  35.37 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  40.24 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  35 
 
 
84 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  39.76 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  41.07 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  32.56 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  30.12 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  42.68 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.82 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 
86 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  42.68 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  32.93 
 
 
83 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  43.24 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  33.71 
 
 
92 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  34.88 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  41.25 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  35.96 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
86 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  38.37 
 
 
98 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  29.76 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  38.82 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.24 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  38.57 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  30.86 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.24 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  27.59 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  34.29 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  31.82 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  35.82 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  34.78 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  31.03 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  34.48 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.68 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  29.21 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  34.48 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  25.32 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  29.55 
 
 
96 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  33.82 
 
 
697 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  30 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  35.96 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.53 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1955  hypothetical protein  28.24 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000490141  n/a   
 
 
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  33.72 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.92 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  28.74 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  35.96 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  27.59 
 
 
95 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>