67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2100 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  100 
 
 		 85 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  71.76 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  63.53 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  60 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  43.9 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  46.99 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  47.62 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  44.58 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  45.78 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.58 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  50.88 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  33.73 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.96 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  32.94 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  34.15 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  42.31 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  32.53 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  43.08 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  35.96 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  38.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  45.45 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  31.03 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.84 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  40 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  33.78 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  34.92 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.26 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  45.45 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.4 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  30.86 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  35.63 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  37.93 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  27.47 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  30.49 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  42.65 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  27.59 
 
 		 103 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  37.78 
 
 		 88 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  23.75 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  27.27 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  23.75 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  23.75 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  30.86 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  36.51 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  37.04 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  40.43 
 
 		 84 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 96 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>