69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1758 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
114 aa  234  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  98.25 
 
 
114 aa  229  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.69 
 
 
94 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  53.26 
 
 
93 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  47.31 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  47.31 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  47.31 
 
 
95 aa  94.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.54 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.47 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  49.46 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  49.46 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.46 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.46 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  47.31 
 
 
94 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  49.46 
 
 
96 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.21 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  46.32 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  46.74 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.74 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  46.32 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  45.16 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  44.09 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  47.87 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  42.39 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  48.91 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  40.62 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  46.24 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  48.39 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  43.48 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  45.35 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  42.39 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  44.19 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.16 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  42.39 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  44.44 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  48.39 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  44.09 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  45.16 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  45.16 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  44.57 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  45.45 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  44.09 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  49.28 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  45.21 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  61.36 
 
 
49 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  45.21 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  43.06 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  59.09 
 
 
49 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  45.74 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  45.74 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  44.68 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  30.3 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  55.81 
 
 
50 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  31.76 
 
 
85 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1797  hypothetical protein  28.71 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.333755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  28.24 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  35.29 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1357  addiction module antitoxin  30.53 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.753541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3095  hypothetical protein  38.1 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
89 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2905  addiction module antitoxin  31.25 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>