71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3300 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  100 
 
 
87 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  67.82 
 
 
87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  71.76 
 
 
85 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  61.18 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  41.67 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  48.24 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  51.43 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  47.62 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  34.52 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  40.96 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.29 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  39.76 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  46.34 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  46.43 
 
 
59 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.04 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  36.47 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  45.12 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  40 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  35.37 
 
 
83 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  34.09 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1955  hypothetical protein  30.59 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000490141  n/a   
 
 
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  40.3 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.66 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  34.15 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.24 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  32.97 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  52.94 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  38.82 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  36.23 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  34.09 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1680  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.521078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  32.1 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  36.26 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  44.44 
 
 
90 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  33.33 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  33.71 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  37.08 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  30 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  28.24 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  36.59 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  27.5 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.53 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  32.56 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 
89 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  30.12 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  27.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  27.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  28.26 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4161  plasmid stabilization system  30.68 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  32.95 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  34.83 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1299  plasmid stabilization system protein  39.66 
 
 
64 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.76 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  32.95 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  25 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4655  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>