78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1338 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
86 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  95.35 
 
 
86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  77.91 
 
 
86 aa  144  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  51.72 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  53.41 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  54.55 
 
 
88 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  53.93 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.44 
 
 
90 aa  94  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.33 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  48.86 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  48.84 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  52.27 
 
 
88 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  52.27 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  44.94 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  47.73 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.23 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  37.65 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.19 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.02 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  36.59 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  36.05 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  36.05 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  37.65 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.47 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  41.18 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  33.72 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 
86 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.77 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  36.05 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  38.82 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  37.35 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  33.75 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  36.05 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  31.4 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  43.64 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  37.93 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  39.29 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 
87 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  31.03 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  35.71 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  46 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  30.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  31.33 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  38.37 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  29.41 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  31.08 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.43 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  30.95 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.25 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2838  hypothetical protein  32.94 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1472  plasmid stabilization system protein  30.49 
 
 
86 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3697  plasmid stabilization system  44.64 
 
 
81 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.967290000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  34.12 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3874  plasmid stabilization system  27.91 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  25.88 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0779  addiction module antitoxin  48.08 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  31.4 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  32.94 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  32.94 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  32.94 
 
 
94 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>