49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1940 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  50.59 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  46.67 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  46.43 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  48.24 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  48.78 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  49.35 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  44.32 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  43.9 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.96 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  39.76 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.94 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.35 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  40.98 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  39.44 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.48 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  32.94 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1850  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0340045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  36.99 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  30.77 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.09 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  34.44 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  33.72 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  35.29 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  38.89 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  34.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.23 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  31.82 
 
 		 92 aa  43.9  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.75 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  40.85 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  35.29 
 
 		 88 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  27.78 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  37.04 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  45.71 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3064  hypothetical protein  34.15 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  35 
 
 		 98 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>