32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2680 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  59.77 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  50.59 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3586  hypothetical protein  53.57 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  46.24 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  46.51 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  44.05 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  45.88 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  38.1 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  36.9 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.72 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  47.06 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  40.68 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  44 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  33.72 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  41.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  38.64 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  35.71 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  45.83 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  29.76 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3209  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  36.84 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  51.52 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.65 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.88 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>