47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1272 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.02 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  34.88 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  38.82 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  34.94 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  37.65 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  37.93 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  39.08 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  41.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  32.95 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  36.9 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.63 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  32.95 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.37 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  42.67 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0269  hypothetical protein  38.64 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  41.03 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  36.47 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  29.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  35.63 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  36.36 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.39 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  35.63 
 
 		 83 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  34.83 
 
 		 89 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.74 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2680  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  30.59 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.76 
 
 		 712 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>