78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3196 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  67.42 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  70.45 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  55.06 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  51.69 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.69 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  48.86 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  45.88 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  48.31 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  48.31 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  50.56 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  50.56 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.94 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.05 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.88 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  43.18 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  45.35 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  44.19 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  40.96 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  34.83 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  30.34 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  38.1 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  35.56 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  35.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  35.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  34.52 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.72 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  32.97 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  37.5 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  30.34 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  35.16 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  31.52 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  32.14 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  30.12 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  35.53 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  35.96 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  44.26 
 
 		 85 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.95 
 
 		 95 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  34.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11272  hypothetical protein  29.89 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00225082  hitchhiker  0.00711105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  24.1 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  36.71 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  32.22 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  32.22 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  32.89 
 
 		 93 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>