46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0812 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  84.52 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  38.82 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.82 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  36.47 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  35.29 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.12 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.76 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  30.12 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  37.93 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  33.33 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  34.12 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  36 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.94 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  35.23 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  34.83 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 
86 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  35.44 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  37.21 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  34.94 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  37.33 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  32.93 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  30.49 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  38.67 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  34.52 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  30.95 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  31.52 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  28.89 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  34.15 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  30 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  28.41 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3992  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0288858  normal  0.818838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3279  hypothetical protein  27.54 
 
 
86 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.741778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  29.41 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.33 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1635  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.537799  hitchhiker  0.001685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  30.38 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3874  plasmid stabilization system  31.33 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>