22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4070 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 80 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0603  plasmid stabilization system  61.25 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.837316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2414  plasmid stabilization system protein  49.33 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.496322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1680  hypothetical protein  49.33 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.521078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  40.96 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1039  plasmid stabilization system  45.33 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6628  hypothetical protein  46.99 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  44.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  34.57 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  35.44 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  37.18 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  38.16 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  37.84 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.93 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.38 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2569  plasmid stabilization system protein  37.14 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>