52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3416 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.53 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  41.18 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.18 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  39.24 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3300  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  36.84 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.51 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  30.12 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.71 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  34.52 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  47.73 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  34.18 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  29.07 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  34.18 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  38.96 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0122  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  35.53 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  35.9 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  34.09 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  27.06 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1272  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.67 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  46.51 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0362351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  42.37 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1956  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296244  n/a   
 
 
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  35.63 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  27.59 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.94 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0773  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  30.38 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2644  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2100  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.60445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4070  plasmid stabilization system protein  38.16 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  40.43 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  47.73 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  30.95 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2645  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0214244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 114 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  35.53 
 
 		 84 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0404  hypothetical protein  33.96 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.111449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  36.71 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  28.75 
 
 		 90 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>