54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0193 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.57 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  53.01 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  47.67 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.84 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  50.6 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.67 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.62 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1261  addiction module antitoxin  51.72 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1292  toxin-like protein  50.57 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  46.59 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4390  addiction module antitoxin  46.59 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1963  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.7 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1617  addiction module antitoxin  48.31 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000591233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.56 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2779  toxin-like protein  37.93 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000388867  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  40 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2032  plasmid addiction system poison protein  43.04 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  43.18 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  38.37 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  38.37 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.36 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.35 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  31.4 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0326  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0239  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0375535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.78 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0812  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00582411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  33.72 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  36.05 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0471  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.16 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000228475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  30.95 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  30.95 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  30.95 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.59 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  30.95 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0126  hypothetical protein  38.2 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  30.38 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  30.34 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7793  toxin-like protein  30.95 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0387  hypothetical protein  29.55 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0473  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000210818  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  33.73 
 
 		 84 aa  40.8  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  41.3 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  33.72 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0406  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  29.07 
 
 		 94 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>